מנחם הופנונג גדל בקיבוץ רמת השופט. למד באוניברסיטה בעברית לתארים בוגר, מוסמך וד"ר במחלקה למדע המדינה. ולתואר LLB בפקולטה למשפטים באוניברסיטה בעברית. בעל הסמכה לעריכת דין. עשה השתלמות פוסט דוקטורט במחלקה למדע המדינה באוניברסיטת קליפורניה באירוויין. באוניברסיטה  העברית כיהן פרופ' הופנונג במגוון תפקידים וביניהם, ראש המחלקה למדע המדינה, ראש תכנית המוסמך במדיניות ציבורית, משפט ומנהל, כראש ועדת ההוראה בפקולטה למדעי החברה באוניברסיטה העברית. עמד בראש מרכז גילה ללימודי אזרחות ודמוקרטיה. כיהן כנשיא האגודה הבינלאומית ללימודי ישראל (AIS) וכיושב ראש האגודה הישראלית למשפט וחברה. בנוסף, עמד בראש ועדת מחקר בינלאומית בנושא מימון ושחיתות פוליטית במסגרת האגודה הבינלאומית למדע המדינה (IPSA).

פרופ' הופנונג כיהן כמרצה אורח וכעמית מחקר באוניברסיטאות ברקלי, אוניברסיטת קליפורניה באירוויין, אוניברסיטת פלורידה, אוניברסיטת פריז בנאנטר, אוניברסיטת מוסקבה אוניברסיטת סידני, אוניברסיטת קליפורניה UCLA, אוניברסיטת סופיה ואניברסיטת ג'ינדל בהודו.

מחוץ לעשייתו האקדמית, הופנונג כיהן כחבר בוועדה לחקר מימון פעילות פוליטית בישראל (בראשות השופט דב לוין), וכן כחבר בוועדת מגידור, ועדת נשיא המדינה לבחינת שיטת הממשל בישראל. בשנים 1996-1997 כיהן כיושב ראש הנהלת ״בצלם״.  בשירות צבאי סדיר היה קצין בנח"ל ובמילואים שירת בגדוד שריון. השתחרר בדרגת רב סרן.

פרופ' הופנונג הוא מומחה למשפט ופוליטיקה. רשימת פרסומיו כוללת מחקרים בנושאי חוק ומדיניות בטחון במשטרים דמוקרטיים, פוליטיקה ומשפט, ומימון מפלגות ומערכות בחירות. מחקרו הנוכחי עוסק בגיוס של ״סייענים״, (משתפי פעולה ערבים במדינות ערב ובשטחים שנכבשו ב-1967) ובשיקומם בתוך מדינת ישראל.

מבין ספריו:

• מנחם הופנונג, ישראל - ביטחון המדינה מול שלטון החוק 1948 – 1991. ירושלים: הוצאת נבו, 1991.
• מנחם הופנונג, מימון מפלגות ומימון בחירות בישראל. ירושלים, המכון הישראלי לדמוקרטיה, 1993.
•           Menachem Hofnung. Democracy, Law and National Security in Israel.

            Aldershot: Dartmouth Publishing Co, 1996.

• מנחם הופנונג, מחאה וחמאה: השפעת הפגנות הפנתרים השחורים על הקצאות לצורכי חברה ורווחה. ירושלים: הוצאת נבו, 2006.
• Reuvn Hazan, Alan Dowty, Menachem Hofnung, Gideon Rahat (Editors).
•  Oxford Handbook of Israeli Politics and Society. 2021.NY: Oxford University Press.